org.biojava.nbio.structure.align.ce

Interfaces

• ConfigStrucAligParams
• MatrixListener
• UserArgumentProcessor

Classes

• AbstractUserArgumentProcessor
• CECalculator
• CeCalculatorEnhanced
• CeCPMain
• CeCPMain.CPRange
• CECPParameters
• CeCPUserArgumentProcessor
• CeMain
• CeParameters
• CeSideChainMain
• CeSideChainUserArgumentProcessor
• CeUserArgumentProcessor
• CeUserArgumentProcessor.CeStartupParams
• GuiWrapper
• OptimalCECPMain
• OptimalCECPParameters
• StartupParameters

Enums

• CECPParameters.DuplicationHint
• CeParameters.ScoringStrategy