Como crio um CrossProductAlphabet, por exemplo, um alfabeto de codons?

Um CrossProductAlphabet resulta da multiplicação de alguns Alphabets. Eles são usados para transformar 2 ou mais Symbols em um único Symbol “cross product”.

Por exemplo:

Utilizando 3 nucleotideos do alfabeto de DNA você pode obter um codon representado por um único Symbol. A partir dai é possível obter uma contabilização dos codons em um objeto Count ou ainda utilizá-los em um objeto Distribution.

CrossProductAlphabets podem ser criados pelo nome (se o componente Alphabet está registrado no AlphabetManager) ou criando uma lista com o auxilio da Classe Collections. Ambas as possibilidades são mostradas no exemplo abaixo:

```java import java.util.*; import org.biojava.bio.seq.*; import org.biojava.bio.symbol.*;

public class CrossProduct {

 public static void main(String[] args) {

   //cria um CrossProductAlphabet a partir de uma Lista
   List l = Collections.nCopies(3, DNATools.getDNA());
   Alphabet codon = AlphabetManager.getCrossProductAlphabet(l);

   //retorna o Alfabeto de codons
   Alphabet codon2 =
       AlphabetManager.generateCrossProductAlphaFromName("(DNA x DNA x DNA)");

   //exibe se os dois alfabetos são canonical
   System.out.println(codon == codon2);
 }

} ```