Comment créer un CrossProductAlphabet tel qu’un Alphabet de codons?

Les CrossProductAlphabets sont le résultat de la multiplication d’autres Alphabets. Les CrossProductAlphabets sont utilisés pour encapsuler 2 Symbols ou plus à l’intérieur d’un même Symbol par “produit croisé”. Par exemple, une opération de multiplication par 3 de l‘Alphabet ADN permettra d’encapsuler un codon en un seul Symbol. Vous pourriez alors compter ces Symbols codons avec un Count ou les utiliser dans une Distribution.

Les CrossProductAlphabets sont crées par nom (si les Alphabets qui les constitutent sont enregistrés avec le AlphabetManager) ou en créant une liste des Alphabets désirés et en fabriquant l‘Alphabet à partir de cette liste. Les deux approches sont utilisées dans l’exemple ci-dessous.

```java import java.util.*; import org.biojava.bio.seq.*; import org.biojava.bio.symbol.*;

public class CrossProduct {

 public static void main(String[] args) {

   // créer un CrossProductAlphabet à partir d'une liste
   List l = Collections.nCopies(3, DNATools.getDNA());
   Alphabet codon = AlphabetManager.getCrossProductAlphabet(l);

   // obtenir le même Alphabet par nom
   Alphabet codon2 =
       AlphabetManager.generateCrossProductAlphaFromName("(DNA x DNA x DNA)");

   // démontrer que les deux Alphabets sont identiques
   System.out.println(codon == codon2);
 }

} ```