Comment lire les résultats d’un fichier de sortie FASTA?

La procédure pour lire les résultats FASTA est très similaire à celle utiliser pour lire les résultats BLAST. En prenant la recette pour le lecteur BLAST, remplacer la ligne suivante:

javaXMLReader parser = new BlastLikeSAXParser();

par

javaXMLReader parser = new FastaSearchSAXParser();

Vous avez maintenant un parser FASTA fonctionnel ;-)