Comment traduire un seul codon À son acide aminÉ correspondant?

La méthode générale de traduction donnée ici montre comment utiliser RNATools pour traduire une SymbolList d’ARN en une SymbolList de proteine mais la plus grande partie du traitement est cachée derrière la méthode translate(). Si vous voulez seulement traduire un seul codon pour obtenir son acide aminé correspondant, vous êtes exposé à un peu plus des détails scabreux mais vous obtenez ainsi la chance de comprendre ce qui se passe sous le capot.

Il y a plusieurs façons de faire, mais une seule est présentée ici.

```java import org.biojava.bio.seq.*; import org.biojava.bio.symbol.*;

public class SingleTranslationDemo {

 public static void main(String[] args) {
   // faire un alphabet composé où les codons sont des Symbols
   Alphabet a = AlphabetManager.alphabetForName("(RNA x RNA x RNA)");

   // obtenir notre table de traduction en utilisant 
   // un des noms statiques de TranslationTable
   TranslationTable table = RNATools.getGeneticCode(TranslationTable.UNIVERSAL);

   try {
     // faire un "codon"
     SymbolList codon = RNATools.createRNA("UUG");

     // obtenir la représentation de ce codon comme un Symbol
     Symbol sym = a.getSymbol(codon.toList());

     // traduire en acide aminé
     Symbol aminoAcid = table.translate(sym);

     /*
      * Cette partie n'est pas nécessaire pour la traduction mais prouve que 
      * le Symbol vient du bon Alphabet. Une Exception sera lancee s'il 
      * ne l'ai pas.
      */
     ProteinTools.getTAlphabet().validate(aminoAcid);
   }
   catch (IllegalSymbolException ex) {
     ex.printStackTrace();
   }
 }

} ```