Come posso tradurre una Sequenza o una SymbolList di DNA o RNA in una Proteina?

Per tradurre una sequenza di DNA bisogna seguire i seguenti passi:

• Trascriverlo in RNA.
• Dividerlo in triplette.
• Tradurlo in Proteina.

Innanzitutto diciamo che per realizzare questi tre passi basta utilizzare i metodi statici di classi già presenti in Biojava. Il blocco seguente di codice mostra come funziona questa procedura. Ovviamente se si ha già una sequenza di RNA non è necessario trascriverla.

Nota Bene:Se si cerca di dividere in triplette una SymbolList o Sequenza la cui lunghezza non è divisible per tre viene sollevata una IllegalArgumentException. Segui questo link per scoprire come ottenere una porzione di una Sequenza per poi tradurla

```java import org.biojava.bio.symbol.*; import org.biojava.bio.seq.*;

public class Translate {

 public static void main(String[] args) {
   try {
     //creo una SymbolList di DNA
     SymbolList symL = DNATools.createDNA("atggccattgaatga");

     //lo trascrivo in RNA (dopo la versione 1.4 di BioJava questo metodo è deprecato)
     symL = RNATools.transcribe(symL);

     //lo trascrivo in RNA  (dopo la versione 1.4 di BioJava si usa questo metodo)
     symL = DNATools.toRNA(symL);
     
     //lo traduco in proteina
     symL = RNATools.translate(symL);

     //verifico
          System.out.println(symL.seqString());
    }catch (IllegalAlphabetException ex) {
     /* 
      * Questa eccezione viene sollevata se si cerca di trascrivere una sequenza che non è di DNA o tradurre 
      * una sequenza che non è una triplet view di una RNA Sequence.
      */
      ex.printStackTrace();
    }catch (IllegalSymbolException ex) {
     // Questa invece accade quando non si utilizzano i caratteri IUB per creare una DNA SymbolList
      ex.printStackTrace();
    }
  }

} ```